Porucha nejen mineralizace, ale i tvorby skloviny a dentinu. Klinicky se projevuje horizontálními rýhami nebo pruhy patologicky změněné, hnědě zbarvené zubní tkáně. Příčinou hypoplazií je jakákoli primární nebo sekundární porucha metabolizmu, která působila v době odontogeneze. Nejčastěji to jsou onemocnění horních cest dýchacích, otitidy a průjmová onemocnění. Dále jsou to karenční stavy, en-dokrinopatie a jiná systémová onemocnění. Podle skupin zubů, které byly postiženy, podle rozsahu a lokalizace změn na zubních korunkách lze usuzovat na dobu vzniku a závažnost onemocnění.